A Port of the Islands Marina situa-se no limite das Ten Thousand Islands, um labirinto de 35.000 acres de ilhotas de mangue onde o Faka Union Canal encontra as águas rasas do estuário do Condado de Collier. Os peixes-boi das Índias Ocidentais — Trichechus manatus latirostris — migram para esses canais salobros a cada inverno quando as temperaturas do Golfo caem abaixo de 68°F (20°C), congregando-se perto de descargas de água morna e afluentes de nascentes que os protegem do estresse causado pelo frio. A subespécie, listada como ameaçada sob a Lei de Espécies Ameaçadas desde 1967 e reclassificada de em perigo em 2017, depende de corredores costeiros rasos para alimentação e reprodução; fêmeas adultas consomem até 150 libras (68 kg) de ervas marinhas diariamente para sustentar seus 1.200 libras (544 kg) de peso. Excursões guiadas de barco partindo da marina navegam pelas hidrovias protegidas do Fakahatchee Strand Preserve State Park e pela borda oeste do Everglades National Park, passando entre raízes de mangue-vermelho e bancos de ostras que abrigam tarpons juvenis, colhereiros e ninhos de águias-pescadoras. Os operadores de eco tour de peixes-boi em Naples, FL, possuem licenças federais emitidas sob a Lei de Proteção de Mamíferos Marinhos, que proíbe perseguição, assédio e contato físico; os capitães mantêm a zona de amortecimento obrigatória de 50 pés (15 metros) em velocidade lenta e educam os passageiros sobre protocolos de observação passiva. As partidas matinais entre 8:00 e 11:00 aproveitam as temperaturas do ar mais frescas e a água espelhada — condições que permitem que hidrofones detectem as vocalizações dos peixes-boi e aumentam a probabilidade de eventos de respiração na superfície. O ecossistema das Ten Thousand Islands funciona como um berçário crítico para as pescarias comerciais do Golfo do México e uma parada migratória para aves canoras neotropicais. Pântanos de capim-serra no interior fazem a transição abrupta para riachos de maré onde a salinidade flutua com o ciclo lunar, criando gradientes que sustentam tanto espécies de água doce quanto marinhas dentro de uma única bacia de maré. Golfinhos-nariz-de-garrafa patrulham os canais mais profundos na maré morta, enquanto crocodilos americanos — a única espécie de crocodiliano simpátrica com os peixes-boi na Flórida — tomam sol em bancos de lama perto da fronteira do parque. Guias naturalistas interpretam a engenharia hidrológica que define a estação chuvosa do Sul da Flórida, o papel da maré de tempestade do Furacão Irma em 2017 na remodelação das ilhas de barreira e a contínua aquisição federal de propriedades privadas para expandir a área contígua da reserva. As excursões de peixes-boi em Naples operam durante todo o ano, embora os avistamentos atinjam o pico de novembro a março, quando agregações de até duas dúzias de indivíduos ocupam as áreas mais quentes do estuário.