La marina Port of the Islands est située au seuil des Ten Thousand Islands, un labyrinthe de 35 000 acres d'îlots de mangrove où le canal Faka Union rencontre les bas-fonds estuariens du comté de Collier. Les lamantins des Antilles — Trichechus manatus latirostris — migrent vers ces canaux saumâtres chaque hiver lorsque les températures du golfe descendent en dessous de 20°C, se regroupant près des rejets d'eau chaude et des affluents alimentés par des sources qui les protègent du stress dû au froid. Cette sous-espèce, classée comme menacée en vertu de l'Endangered Species Act depuis 1967 et reclassée depuis 2017, dépend des couloirs côtiers peu profonds pour se nourrir et mettre bas ; les femelles adultes consomment jusqu'à 68 kg d'herbes marines par jour pour maintenir leurs 545 kg. Les excursions guidées en bateau au départ de la marina naviguent dans les voies navigables protégées du parc d'État de Fakahatchee Strand et de la frange ouest du parc national des Everglades, serpentant entre les racines des palétuviers rouges et les bancs d'huîtres qui abritent des tarpons juvéniles, des spatules rosées et des balbuzards nicheurs. Les opérateurs d'éco-excursions avec les lamantins à Naples, FL, détiennent des permis fédéraux délivrés en vertu du Marine Mammal Protection Act, qui interdit la poursuite, le harcèlement et le contact physique ; les capitaines maintiennent la zone tampon de 15 mètres à vitesse réduite et informent les passagers sur les protocoles d'observation passive. Les départs matinaux entre 8h00 et 11h00 profitent de températures de l'air plus fraîches et d'une eau calme — des conditions qui permettent aux hydrophones de détecter les vocalisations des lamantins et augmentent la probabilité d'événements de respiration en surface. L'écosystème des Ten Thousand Islands fonctionne comme une pépinière essentielle pour la pêche commerciale du golfe du Mexique et une halte migratoire pour les oiseaux chanteurs néotropicaux. Les marais de scirpes à l'intérieur des terres se transforment brusquement en criques de marée où la salinité fluctue avec le cycle lunaire, créant des gradients qui soutiennent à la fois les espèces d'eau douce et marines au sein d'un même bassin de marée. Les grands dauphins patrouillent dans les canaux plus profonds à marée étale, tandis que les crocodiles américains — la seule espèce de crocodilien sympatrique avec les lamantins en Floride — se prélassent sur les vasières près de la limite du parc. Les guides naturalistes interprètent l'ingénierie hydrologique qui définit la saison des pluies en Floride du Sud, le rôle de l'onde de tempête de l'ouragan Irma en 2017 dans le remodelage des îles-barrières et l'acquisition fédérale continue de parcelles privées pour étendre la superficie contiguë de la réserve. Les excursions avec les lamantins à Naples fonctionnent toute l'année, bien que les observations atteignent leur apogée de novembre à mars, lorsque des agrégations allant jusqu'à deux douzaines d'individus occupent les poches les plus chaudes de l'estuaire.